Naantalin seurakuntayhtymän muodostavat yhdessä Naantalin alueen evankelisluterilaiset seurakunnat: Merimasku, Naantali ja Rymättylä. Seurakuntayhtymän tehtävänä on huolehtia yhtymän muodostavien seurakuntien talous- ja palkkahallinnosta, kiinteistöistä, hautaustoimesta, yhteisestä viestinnästä ja ympäristötyöstä.